近日,我校生命科學學院王占旗副教授與中國農科院植保所/浙江大學周雪平教授團隊和浙江大學李飛教授團隊聯合構建了雙生病毒-植物-昆蟲數據庫GPIBase(Geminiviridae-Plant-Insect Database),研究成果“GPIBase: A comprehensive resource for geminivirus–plant–insect research”正式發表于國際著名學術期刊《Molecular Plant》(中科院一區TOP,2021IF = 21.95,2022即時影響因子IF = 26.52)。

該數據庫共包括五大主要模塊:
1)“Browse”:包括雙生病毒、病毒宿主、病毒寄主以及病毒伴隨衛星β信息的完整搜索與下載,同時詳情界面提供了全面的基礎與遺傳信息;
2)“Network”:將病毒-植物-昆蟲的互作關系通過網絡結構進行可視化,直觀分析不同病毒、宿主和寄主的關系;
3)“Phylogeny”:基于雙生病毒全基因組序列比對,構建了目前最為全面的雙生病毒科的系統發育關系;
4)“Tools”:提供了BLAST功能進行病毒基因蛋白的比對與搜索;
5)“Literature”:及時更新雙生病毒相關的研究進展,同時通過分析雙生病毒文獻作者,初步構建了國際雙生病毒研究人員社區。該數據庫為雙生病毒的后續研究提供了便捷和重要基礎。
GPIBase提供了最完整的雙生病毒、病毒寄主信息、病毒媒介遺傳信息,病毒-植物-昆蟲互作信息以及多種在線工具,可實現相關文獻同步更新,并初步搭建了國際雙生病毒研究人員社區。
論文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1674205223000400
通訊員:姜露
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